Wie praktisch alle HIV-Medikamente kann auch Abacavir (Ziagen®) eine Reihe an Nebenwirkungen haben. Die wichtigste, weil recht häufig und in voller Ausprägung bedrohlich, ist eine Überempfindlichkeitsreaktion. Bei rund 5% aller mit Abacavir Behandelten tritt eine solche Reaktion auf.
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